水產養殖目前還處在以野生物種馴化養殖為主 、人工遺傳改良品種為輔的生產階段 。由於無意識地近親繁殖 ，導致很多養殖品種的種質從20世紀80年代就相繼出現退化現象 。國家因此設計了國家級水產原良種場 、引種中心和遺傳育種中心三條良種化的技術路線 ，來解決苗種繁殖場優質親本的生產供應難題 。

 

    從20世紀90年代初開始 ，我國有計劃 、大規模地推進水產品種創新和原良種體係建設 ，特別是1998年以來 ，中央財政建立了全國水產良種工程基本建設專項 ，加大對水產種業的支持力度 ，促進了水產原良種體係形成和完善 。截止到2013年 ，已經建立了65家國家級的原種場 、良種場 ，575家省級水產原良種場 ，目前正在建的水產種業示範場超過60個 。而從上個世紀90年代開始成立的國家水產原良種審定委員會，直到2014年一共審定了156個新品種 ，2015年又審定了12個新品種(具體要等到2016年3月發布) 。每一個良種都或多或少會帶動相應產業鏈的發展 。

 

    但良種不是“萬金油”，並非可以滿足養殖者對高頻養殖和高產的極限化追求 。越來越多的跡象表明 ，病害的爆發跟養殖者的養殖模式息息相關 。比如江蘇的鯽魚 ，因為此前養殖效益比較好 ，導致一些養殖戶養殖量越來越大 ，忽視了養殖和環境的平衡 。過去的養殖是春夏秋養殖 ，冬季幹塘 、曬塘 ，讓池塘有一個修複的過程 ，但現在很多地方都是一年四季不間斷在養 ，導致一些病菌不斷滋生 。再者 ，高密度的養殖對魚本身的免疫係統造成損害 ，先天性免疫係統長期趨於一種高應激狀態 。當爆發嚴重病害時 ，魚類自身沒有潛能去啟動免疫反應來抵抗各種病原的侵襲 ，從而導致出現一些新型病例 ，並誘發出其它一些病害 。